Jurusan Perbankan Syariah SMK Muhammadiyah Kesesi menjalin kerjasama dengan Bank Syariah Indonesia Kantor Cabang Kajen Pekalongan, bentuk kerjasama yang dijalin adalah Jurusan Perbankan Syariah SMK Muhammadiyah Kesesi menjadi binaan Bank Syariah Indonesia, Manajer BSI Bapak Aji Mulyanto, M.Ed siap menjadi guru tamu di SMK Muhammadiyah Kesesi dan membina para siswa untuk lebih memahami Perbankan Syariah, tidak hanya itu BSI juga siap mendampingi siswa dalam menuju rekrutmen  ke Perbankan Syari'ah.